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2014年加拿大教育局在家长的抗议下停止了与孔子学院的合同
（博谈网记者苏智敏报道）俄罗斯的布拉戈维申斯克检察院发表声明，认为孔子学院是“外国代理人”机构，要求暂停其一切教学活动。
孔子学院被指是“间谍”机构
俄罗斯多家媒体28日报导，布拉戈维申斯克检察院发表声明称，隶属于该市国立师范大学的孔子学院，其成立“违反了俄罗斯境内外国文化中心相关法律”，向法院提起申请，要求暂停一切教学活动。另外，孔子学院还被认为是“外国代理人”机构（此名词通常被用作“间谍”代称），本质是非政府组织，参与政治活动，设立孔子学院的布拉戈维申斯克国立师范大学也多次从外国机构获得资金。另据俄罗斯卫星网报道，检察院称，该孔子学院“没有在税务机构登记，没有聘请外籍教师从事教学活动的法律依据”。法院计划于8月4日对此案进行审理。
对检察院的指控，校方持否认态度，认为孔子学院活动合法。据俄媒报导，该校孔子学院院长尼古拉•库哈连科辩解说，学院是依据中国黑河学院和布拉戈维申斯克国立师范大学达成的合约成立，而且俄罗斯教育法律允许高校开设由外国合作伙伴参与的分支机构，孔子学院不是非政府组织。他对俄罗斯卫星网说：“我们没有独立法人资格，没有独立的银行账户。我们使用校方的账户，资金通过联邦国库转账，一切都很透明。”
中国驻俄大使馆工作人员接受俄媒《生意人报》采访时，回应这是个别事例，不代表俄官方立场，问题将得到解决。另俄新社称，俄罗斯教育与科学部代表团正在访问中国，届时会同中方讨论此次孔子学院事件。
威胁学术自由
根据孔子学院官方网站的资料显示，截至2014年12月7日，全球有126个国家（地区）建立475所孔子学院和851个孔子课堂。孔子学院对外宣称是开展汉语教学和中外教育、文化等方面的交流合作，发展中国与外国的友好关系，促进世界多元文化发展。但是孔子学院自创办后，就一直备受争议，外界认为这个中国官方掌控的汉语推广组织，可能如特洛伊木马一样，除了教授汉字外，恐被赋予散布中共意识形态的任务，试图影响世界对中共政权的看法。
2013年11月，芝加哥大学教授Marshall Sahlins在《国家》杂志发表文章，例举孔子学院以政治敏感为由干预学术的几个例子：北卡罗来纳州立大学因孔子学院的反对而取消达赖喇嘛的访问；雪梨大学因孔子学院反对而一度考虑取消达赖喇嘛的访问；滑铁卢大学的孔子学院曾动员学生支持中国镇压西藏抗暴；麦克马斯特大学与台拉维夫大学则因孔子学院的反法轮功活动而面临法律问题。
2014年美国芝加哥大学一百多名教授联署，呼吁院方不要续签孔子学院的合同，担心这对美国学术自由带有潜在威胁，同时指出芝大孔子学院的中文教师聘用、教学以及研究计画资金，都由中国的“国家对外汉语教学领导小组办公室”掌控大部分权力，认为由外国政府来决定美国学校项目是完全不合理的。
《华盛顿邮报》2014年发表社论，同样表达高度忧虑，认为孔子学院等于是中共在美国大学内设立了“党委支部”，有了“中共特务租界”。
多年来，由于类似的争议层出不穷，部分大学陆续关闭了孔子学院。因此芝加哥大学这份百名教授联署声明出来后，中国官媒新华网也发表评论《抵制孔子学院损害中西文化交流自由》反击，文中对干扰学术自由、利用孔子学院进行意识形态输出的指责皆予以否认，称中方从未对孔子学院施加影响。
随中共利益起伏的“孔子”
孔子在中国的地位可谓大起大落，文革时期，孔子的学术言论被禁止，红卫兵还捣毁孔子故居、坟墓，大量的孔府、孔庙、孔林被摧毁。文革结束后，许多学者认为被破坏的文化瑰宝及民族精神，至今仍难以估量其带来的严重后果。
而在文革时期一文不值的孔子，如今成了中共的宣传工具，除了设立有“外国代理人”嫌疑的孔子学院，还设立了孔子和平奖，外界认为这是为了抵制诺贝尔和平奖而另起炉灶设立的奖项。中国网友则认为这不仅侮辱孔子名誉，也丢了国人的脸，网友以“让中国人汗颜的笑话”、“对孔子的亵渎”和“山寨和平奖”来形容此奖项。
日本人也在抗议孔子学院
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