为了调查钓鱼群岛的生态环境，日本冲绳石垣市委托日本东海大学教授山田吉彦等，于4月26日、27日两天在钓鱼岛海域进行了调查，4月27日，石垣市市长中山义隆、东海大学教授山田吉彦、自民党议会议员联盟“尖阁诸岛调查开发推进会”会长、前防卫大臣稻田朋美、该会干事长山田宏、众议院议员樱田义孝、参议院议员青山繁晴、日本维新会众议院议员和田有一郎一起参加了调查和视察，视察过程中遭遇中国海警船，出现了比较惊险的场面。
在视察时，一艘进入钓鱼岛周边日本认为是“领海”水域的中国海警船在调查船附近行驶，并接近调查船，最近距离约1公里远， 一艘日本海上保安厅巡逻艇处于戒备状态，并在电子公告牌上用中文和日文向中国海警船发出警告，并挡住中国海警船。返回港口后，中山市长在接受媒体采访时表示：“在调查的第二天，中国海警船逼近，海上保安厅阻止了他们，但当时非常紧张。”
据说该岛的生态环境可能已经发生了重大变化，专家们呼吁登岛调查，但是这次环境生态调查因中国海警船接近考察船而被迫取消部分计划。稻田朋美等5名国会议员在钓鱼岛海域停留约4个小时，中国海警船在他们所乘的日方调查船踏上归途时仍然在后面追踪。
这次调查引来日中间的外交风波。
4月29日，中国外交部发言人林剑主持例行记者会。
深圳卫视记者提问：据媒体报道，日本自民党代理干事长稻田朋美等5名国会议员参加石垣市政府组织的“调查团”，进入钓鱼岛领海进行“视察”。请问中方对此有何评论？
林剑回答说：“钓鱼岛及其附属岛屿是中国固有领土。针对日方有关侵权挑衅行径，中方已经通过外交渠道向日方提出严正交涉。中方将继续采取一切必要措施，坚决维护国家领土主权。我们敦促日方恪守中日四点原则共识，立即停止一切挑衅和单方面升级事态的做法，切实尊重中国主权和领土完整。”
日方在这次调查中使用了无人机，从无人机拍摄的画面看，可以看到沿海地区散布着白色物体。
据参加调查的东海大学的山田吉彦教授称，这些实际上是中国渔民扔掉的垃圾堆，另外还有其他异常。在12年前的调查中，肉眼就能看到很多山羊，但现在看到的画面是裸露的山体，说明连山羊都无法生存。专家们根据们这些情况分析，认为岛上水源的枯竭正在加剧。
山田吉彦教授指出：水源稀缺，整个岛屿都开始干旱，我们需要尽快进行登陆调查。（见5月3FNN Prime Online网络新闻《“紧迫的海”尖阁诸岛，日本和中国船只对峙，首次无人机调查……因中国海警船接近而中止》）
1978年，日本右翼团体日本青年社欲登岛建立灯塔，以向世界宣示钓鱼岛是“日本的领土”，他们说钓鱼岛周边岛上的人们担心他们去岛上建灯塔后，前来迎接他们的船只迟迟不能到达，作为食物送给他们两头山羊，雌雄各一头，他们建完灯塔后，就把两头山羊放到了岛上，第二年去修理灯塔时，繁殖成数头山羊，在几年以后，已达几百头。
日本石垣市方面认为：如果不及时捕获那些山羊，它们有可能吃光岛上的植被，会对自然的生态环境发生影响，因此应该迅速到岛上进行调查并采取保护措施。
2022年3月，石垣市委托日本东海大学总结了《2022年度石垣市周边海域现状调查报告书》，报告书指出：
因为存在着钓鱼群岛的鱼钓岛上因山羊啃食导致植被减少的问题，因此，这次调查对鱼钓岛的植被状况进行了观察。海岸漂浮垃圾和海洋漂流垃圾也是重大环境问题。因此，这次调查也对钓鱼岛海岸漂浮垃圾的情况以及在石垣岛和钓鱼岛之间航行时海洋漂流的垃圾进行了调查。
由于这次调查的观察仅限于船上观察和拍照，因此无法准确分析过去已确认的植被减少（裸地扩大）现象，但可看到，2014年时，没有植被的裸地在南侧较为突出，而现在正向北侧扩大，可以推测山羊的啃食之害可能已经蔓延到了鱼钓岛整个岛屿。
在无法了解山羊数量的现状下，这次调查研究只好仅限于推测，但钓鱼岛是珍贵的野生动、植物的宝库，因此，实施登岛调查或利用无人机进行调查等，准确了解山羊的生息情况和植被状况之间的关系，并根据这些信息采取适当的措施，是当前亟待解决的问题。
据悉，钓鱼岛上栖息着许多原生物种，如钓鱼岛鼹鼠、黑线姬鼠等岛上原生的小型哺乳动物，还确认有钓鱼岛穴螺、热带蜗牛等原生的陆生贝类，钓鱼岛有许多野鸟繁殖，现在至少生息着34种鸟类，被选定为世界共同标准的重点鸟区（IBA），在世界上确认仅存约500-1000只的短尾信天翁，也在2005年于钓鱼群岛北小岛和南小岛发现，约有250只，分布于世界各地的热带海洋地带的蓝脸鲣鸟也是非常珍贵的鸟类，数量非常稀少，其太平洋亚种，生息在钓鱼岛和日本的西之岛。钓鱼岛昆虫有100多种，而从植物来看，有稀有的钓鱼岛金丝桃、钓鱼岛杜鹃等大约560种植物，还有山茶、棕榈、马齿苋、仙人掌等，岛上也生长无数珍贵的药材，有一种叫海芙蓉的海草，生长在沿岸的岩石缝隙中，是防治风湿症和高血压的良药。钓鱼岛周边有丰富的海洋生物资源，钓鱼岛及其附属岛屿位于温暖的黑潮流域，海洋生物资源非常丰富，主要捕捞品种有黄鳍马面鲀、短尾大眼鲷、鲐鱼、绿鳍马面鲀、竹荚鱼、蓝圆鲹、鮀鲣、鲨鱼类等，过去的人们认为岛屿周边有大量鱼群而将其命名为“钓鱼岛”，此外周边海中的珊瑚群也很珍贵，钓鱼群岛是一个“自然宝库”，石垣市方面担心：漂流垃圾等会破坏这些动植物的生态系统。
而今年的调查显示现在情况更加严重，可能绿色植被已经快被山羊吞噬殆尽，因此为了解决钓鱼岛的生态问题，需要登岛调查并适当解决，但是实际管辖钓鱼岛的日本方面已经越来越难登岛调查和驱除山羊，同乘调查船的前去调查的石垣市中山义隆市长再次指出：要阻止生态系统的破坏，需要研究人员和行政官员登陆岛屿，详细调查现状，并采取除山羊等措施。
但是中国强烈主张钓鱼岛的领有权，在周边海域常驻4艘舰船，经常进入钓鱼岛周围日本认为是“领海”的水域，阻止日本渔船捕鱼的行为常态化，登岛调查更是难上加难。
中国全国人民代表大会2021年2月1日开始实行《中华人民共和国海警法》，规定当外国船违法进入中国领海，海警局可强制驱赶或进行调查，其中还规定，若发生外国船只在中国管辖海域违法活动，且不遵从海警局要求停船的命令等情况，海警局可动用武器。
因此，现在中国海警船和日本海上保安厅的巡视船擦枪走火的可能性十分之大，而中国海警舰的吨位大大超过日本海上保安厅的1千吨级的巡视船，其武力高高凌驾于日本巡视舰之上，因此日本方面觉得十分危险。
但是如果这种情况持续下去，钓鱼岛的生态环境将越来越坏，因此主权争端与保护钓鱼岛的生态环境发生了严重的冲突和对立，在政治与主权的纷争中，对环境与生态问题只好弃之不顾，而要解决这个问题，只有通过日中两国相关部门积极接触，通过谈判和协商解决。1978年10月，时任中国副总理的邓小平为交换中日和平友好条约批准书访日，同日本首相福田赳夫会谈后在记者招待会上就钓鱼岛问题表示：“我们这一代人智慧不够，这个问题谈不拢，我们下一代人总比我们聪明，总会找到一个大家都能接受的好办法，来解决这个问题”。也许，日中通过协商合作，共同解决钓鱼岛的生态问题，会提供一个良好的契机，促使双方找到一个“大家都能接受的好办法”，否则具有重要生态与环境意义的钓鱼岛将变成一个光秃秃的荒岛。
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