对于台湾总统选举结果，台湾学者作出不少分析。有认为：选举结果是总统蔡英文8年执政的体现，不过民进党虽然总体经济很好，但治理、分配有问题，无法有效解决低薪高房价，因此流失年轻选票；而国民党则是困在九二共识中，没能成为主流民意。
据中央社报道：东海大学政治学系副教授林子立说，此次赖清德能打破8年执政束缚，立下民主里程碑，最重要原因除了中国介选也有内政因素，选举结果可说是展现蔡总统执政以来的民意，同时显示3党支持度都有各自的天花板。
他表示，民进党在总体经济成绩很好，但治理、分配有问题，无法解决低薪、高房价、就业环境差，年轻人选票就流向柯文哲；国民党败因则是还困在九二共识当中，在全世界都在去风险化时，国民党却想走向中国这单一市场、重启服贸，这样的政治诉求显然无法获得主流民意支持。
至于朝小野大的结果，林子立说，民进党赢了总统，选民却分裂投票，无法成为国会最大政党，这说明了大家对于民进党完全执政并不放心，但这也是全球化下的困境，就是国家虽然在进步，可分配出了问题，相关分配议题将来也会是赖清德的考题。
成功大学政治系教授王宏仁说，赖清德最终得票率与历次民调预估差异不大，倒是柯文哲从原本估计2成左右的支持度，来到26%左右，可说虽败犹荣，也展现第三大党实力。
对于赖萧配胜选原因，除了赖清德政策论述完整，预计在总统蔡英文基础之上持续扩大施政，萧美琴也绝对是关键之一。他说，萧美琴从民意代表到驻美大使的资历完整、形象正面、身段也柔软，以战猫之姿在外交战场打拚，拥有坚韧又不失温柔的弹性，加以返台后公开谈话都展现对政策的熟稔，相比其他副手人选，加分不少。
王宏仁也说，选举尾声就是比谁犯的错比较少，侯友宜、赖清德、柯文哲表现未有太大差池，倒是前总统马英九的“两岸关係应该要相信习近平”的说法，恐怕吓走不少原先要投国民党的中间选民，帮了侯友宜倒忙；而中国频繁的文攻武吓其实也是两面刃，虽然引起部分台湾人忧虑，也引起反感。
林子立则认为，马英九提及“两岸关係应该要相信习近平”这句话虽然不受喜爱，但封关民调跟选举结果差距不大，显示马英九已经没有太多影响力，且事实上中国每次的作为都是民进党的助选员，包含认知作战、以商逼政等做法越来越精细，而台湾民众还是勇敢选择跟世界潮流站在一起。
不过林子立也提醒，这个选举结果恐让中国加紧对台湾的经济制裁，改变以中国为市场的布局是重中之重，必须积极与欧美合作前进印太，否则会增加经济风险。
第16任总统副总统选举投票落幕，中央选举委员会中央选情中心晚间9时57分开票完毕，民进党总统副总统候选人赖清德、萧美琴拿下最高票，共获558万6019票、得票率40.0503%。国民党总统副总统候选人侯友宜、赵少康则以467万1021票、得票率33.49%居第二；民众党总统副总统候选人柯文哲、吴欣盈拿下369万466票、得票率26.4597%第三。
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