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尽管马英九面对国内外众多的挑战质疑，他仍以维持两岸和平为他最重要的目标。事实上，他的政策一开始颇受欢迎，两岸也签署了超过二十项的协议，尽管这些协议并无拘束力，实质上却促成了两岸前所未有的经济、文化交流。
之前那种剑拔弩张的情势好像缓和下来，随着两岸直航班机不断增多，数以百万计的人得以快速而方便的跨过台湾海峡旅行，跨过这一道长久将他们分隔、波涛汹涌的黑水沟。许多美国专家忧心，依此情势继续发展下去，台湾可能会被吸进中国的轨道里了。
但北京并没有把握眼前的机会。就算马英九想推出较有包容性的两岸政见，北京政府也不领情，从而错失海峡和平的机会。中国要的是征服台湾，不是维持和平现状。从中国政府高层不断整军经武，并拒绝撤除对准台湾的飞弹，即可得知其侵略的意图。中国的两岸政策，持续以威吓为主，并不考虑任何妥协和包容的空间。
渐渐地，台湾本土观察家开始相信，如果台湾政府释出越多善意希望降低两岸张力，就只是鼓励对岸步步进逼，要台湾屈服北京的要求，变成中国的一部份。眼看着香港的自治权在过去这二十年来不断流失，基本人权也受到打压，台湾人民对中国已经完全不抱任何希望，中国不可能承认台湾政府的正当性，也不可能尊重台湾人民想要自己决定自己命运的权利。
另外，台湾人和来台陆客接触的经验普遍非常负面，这让台湾人对“一个中国”的政策，更加抗拒。2008年以前，绝大部分的台湾人民对中国大陆的认识极其有限，很多人从未与对岸任何人接触过。2008年之后，大批中国观光客以及经贸团涌进台湾，在他们停留期间，几乎毫无例外的给台湾人民留下了恶劣的印象。一位马英九的重要顾问曾说过：“台湾人民对中国人民的接触与了解更多，他们就更不愿意成为中国人。”
台湾人民已经形成一个共识，他们无法忍受眼睁睁看着台湾一天一天的被中国影响，直到有一天他们的自由以及命运，完全任由中国的喜恶决定。2014年3月，大批学生以及民运团体佔领了台湾国会，“太阳花”运动就此诞生。这场运动为时三个星期，成功冻结了一项有关两岸经贸的协议，以防充满敌意的对岸继续加强对台湾的影响。这些事件虽多半肇因于人民对马政府过度向对岸倾斜的经济政策不满，但除此之外还有另外一个原因，就是人民开始对台湾的国防安全，产生重大疑虑。
在太阳花运动之前不久，中华民国国防官员收到一份情资，让他们大吃一惊，于是决定将此情报对民众公开，即使这意味着公开告诉所有人，马政府在两岸和平的努力已完全付诸流水。2013年底，台湾国防部公开指出，中国已做出规划，可在2020年之前进攻台湾。中国的这个计划，是在中国共产党第十八次全国代表大会中，习近平和胡锦涛进行权力交替之时做好的。该次会议中，中国新的领导班子承诺将在2020年以前完成所有攻台部署。
虽然在之前的四年，两岸情势和缓不少，但中国共产党和人民解放军并不愿接受和平的选项，他们认为仍需继续计划武力攻台。因着这份攻台计划的公开，加上中国三不五时的挑衅，台湾人的自我认同也随之变化，对中国的厌恶及不认同日渐加深。2016年1月，在野的民主进步党在总统及国会大选中赢得压倒性胜利。同年5月20日，台湾的新领导人蔡英文博士宣誓就职，成为台湾第一位女性总统。
在政权交接以及执政初期时，北京政府透过各种威吓手段，试图对蔡政府施压，希望她接受“一个中国”的观念。这些手段包含来台陆客人数大量减少、两岸沟通管道中止、共军展开两栖作战兵棋推演，甚至还派出轰炸机和小规模舰队不时环绕台湾四周海空域。不过这些胁迫行动并没有收到效果，蔡英文贯彻台湾人民意志的决心，没有丝毫动摇。到了后来，中国虽然持续威胁恫吓，却越来越空洞，只能警告着说最厉害的招数还在后面。
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