在台湾的蔡英文政府上台后，由亲绿的台湾民意基金会公布的最新民调指出，超过五成一的民众赞成，未来台湾要独立。八成的人自认为自己是台湾人，这两项调查的数字，都创下新高纪录。有学者解读，若是两岸都靠民意来制订政策，这对两岸关系相当危险。
台湾民意基金会，周五公布的最新民调显示，新上任的蔡英文总统，声望超过七成，与扁马上台的蜜月期，民调相当。而绿营执政后，赞成台湾独立，也首度超过五成，认为两岸同属一中的比例，仅仅不到两成。对于蔡英文总统，不再谈“九二共识”，而是依据宪法和两岸关系条例来处理两岸问题，有超过七成的民众表达赞同。
长期研究美中台关系的学者黄介正巧妙比喻，蔡英文的就职演说，只做了心脏绕道手术，没有解决DNA问题，现在病人还在恢复室，就看病情会好转还是恶化。
“不是看心脏绕道手术，他是要DNA啊，滴血认亲啊！两岸一家亲啊。所以要每个人拿来滴看看是不是一家人。这民调结果，这对中国大陆来讲，这个DNA已经『异化』”。
不只是认同台独的数字创下新高，认同自己是台湾人的比例超过八成，远远大于对中国人身份的认同。曾担任马政府时代，两岸政策重要智囊的赵春山教授指出，这数字不令人意外，最担心两岸如果升高到民意冲突，双方都挟民意来制订政策，相当危险。
淡江大学教授赵春山表示，“520之后，我认为两岸关系已经倒退到，比当时扁政府还要忧心，但是“这门并没有关”。两岸完全恶化到一个程度也不符合双方利益，那么这时候就是怎样找到下台阶。”
对于台湾人民只把两岸关系着重在经济因素，忽略地缘关系，世新大学教授彭怀恩提出警告，这是非常危险的事。
彭怀恩指出，“因为现在地缘因素才是重要因素，而且我担心台湾变成，乌克兰和克里米亚，这点大家一定要小心，因为我们距离大陆太近，距离美国太远。”
在民进党上台后，台湾认同民意高涨，台湾民意基金会董事长游盈隆也呼吁，两岸政府，尤其是中共当局，必须勇于面对，冷静处理，不要让两岸关系，再次倒退。
自由亚洲电台记者黄春梅 台北报道
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